《扁鹊心书》1146年成书，清乾隆乙酉(1765)王琦重刊。全书三部分：上卷计有论述10篇，灸法3篇，概述其主要医学观点，兼录前人和作者的灸法、中卷载病64种，计64篇；下卷载病53种，及《周身各穴》，计54篇。卷末有附神方计94首，附“金线重楼治证”、“服金液丹各种引药”、“神治诸般风气灵膏”、“汗斑神效方”各1篇。窦氏学术思想重视扶阳，反对妄用寒凉攻下药，验于临床疗效卓著。